این سازمان تلاش می‌کند تا با افزایش تولید محصولات کشاورزی، تأمین نیازهای غذایی کشور را برآورده کرده و وابستگی به واردات را کاهش دهد. 

 

حفاظت از خاک، آب و سایر منابع طبیعی از جمله وظایف مهم سازمان جهاد کشاورزی است. این سازمان با برنامه‌ریزی و اجرای طرح‌های مختلف در این زمینه، تلاش می‌کند تا از تخریب منابع طبیعی جلوگیری کند. 

 

یکی دیگر از مأموریت های مهم سازمان جهاد کشاورزی در زمینه مدیریت اراضی است. این سازمان با نظارت بر بهره‌برداری از اراضی ملی و دولتی، تلاش می‌کند تا از سوء‌مدیریت و تخریب اراضی جلوگیری کند. 

 

همچنین سازمان تلاش می‌کند تا با تسهیل شرایط سرمایه‌گذاری و فراهم کردن زمینه برای مشارکت بخش خصوصی، توسعه بخش کشاورزی را تسریع کند. 

 

از دیگر مأموریت های این سازمان می توان ساماندهی بازارها و شبکه توزیع محلی را نام برد.